日本高等学校野球連盟と朝日新聞主催による第88回全国高等学校野球選手権大会は、2006年8月6日（日）から20日（日）までの15日間（雨天順延）、兵庫県西宮市の阪神甲子園球場で開催される。
大会日程は以下の通り。
【第88回全国高等学校野球選手権大会大会日程】
《抽選会》
———————
8月3日（木）
16:00分 第1回抽選（＠フェスティバルホール）
《1回戦》
———————
8月6日（日）《第1日》
09：00〜開会式
10：20〜第1試合
12：50〜第2試合
15：20〜第3試合
8月7日（月）《第2日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月8日（火）《第3日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月9日（水）《第4日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月10日（木）《第5日》
09:30〜第1試合
12:00〜第2試合
《2回戦》
———————
14:30〜第3試合
8月11日（金）《第6日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月12日（土）《第7日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月13日（日）《第8日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月14日（月）《第9日》
09:30〜第1試合
12:00〜第2試合
14:30〜第3試合
《3回戦》
———————
8月15日（火）《第10日》
08:30〜第1試合
11:00〜第2試合
13:30〜第3試合
16:00〜第4試合
8月16日（水）《第11日》
8:30〜第1試合
☆準々決勝の抽選
11:00〜第2試合
01:30〜第3試合
04:00〜第4試合
《準々決勝》
———————
8月17日（木）《第12日》
11:00〜第1試合
☆準決勝の抽選
01:30〜第2試合
8月18日（金）《第13日》
11:00〜第1試合
13:30〜第2試合
《準決勝》
———————
8月19日（土）《第14日》
11:00〜第1試合
13:30〜第2試合
《決勝》
———————
8月20日（日）《第15日》
13:00〜決勝
※試合終了後閉会式
———————
※準々決勝からの組み合わせ抽選は阪神甲子園球場で行う